88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0047 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  64.34 
 
 		 1898 aa  965    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  53.72 
 
 		 1946 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  100 
 
 		 1441 aa  2901    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  55.9 
 
 		 1482 aa  311  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  44.71 
 
 		 1809 aa  281  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  39.26 
 
 		 2078 aa  273  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  39.38 
 
 		 3634 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  42.41 
 
 		 2853 aa  267  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  42.5 
 
 		 2886 aa  261  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  40.57 
 
 		 3486 aa  231  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  40.16 
 
 		 2412 aa  171  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1285 aa  125  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  24.86 
 
 		 4897 aa  99.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 		 3471 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.26 
 
 		 1118 aa  95.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1332 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 2000 aa  88.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1059 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 1984 aa  85.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  44.55 
 
 		 3771 aa  83.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  41 
 
 		 3360 aa  83.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  27.35 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  36.59 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1757 aa  77.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  24.46 
 
 		 4896 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  36.95 
 
 		 8918 aa  74.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.86 
 
 		 2434 aa  73.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  28.03 
 
 		 2118 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  26.79 
 
 		 909 aa  70.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1230 aa  70.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  28.26 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1003 aa  68.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.46 
 
 		 2487 aa  65.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1580 aa  65.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2490 aa  65.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.06 
 
 		 3921 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  30 
 
 		 703 aa  64.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.74 
 
 		 5010 aa  64.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.3 
 
 		 1989 aa  62.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  31.13 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  26.35 
 
 		 2490 aa  63.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2358 aa  62.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2358 aa  62.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  36.02 
 
 		 2912 aa  62.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.35 
 
 		 2490 aa  62.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2490 aa  62.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  25.8 
 
 		 2490 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  26.03 
 
 		 2485 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.8 
 
 		 5010 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  29.2 
 
 		 2418 aa  59.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  28.52 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  24.24 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  30.26 
 
 		 898 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.42 
 
 		 5010 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  22.87 
 
 		 5010 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  36.92 
 
 		 2487 aa  57  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  24.68 
 
 		 2520 aa  55.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.21 
 
 		 5017 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  25.21 
 
 		 5017 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.21 
 
 		 5017 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.83 
 
 		 3911 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  23.72 
 
 		 5017 aa  53.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  25.21 
 
 		 5017 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  24.38 
 
 		 440 aa  53.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  25.81 
 
 		 714 aa  52.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  27.33 
 
 		 983 aa  53.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  24.06 
 
 		 2490 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  24.51 
 
 		 1248 aa  53.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  29.41 
 
 		 757 aa  52  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  24.35 
 
 		 2113 aa  52  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  24.6 
 
 		 1533 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.73 
 
 		 2573 aa  51.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.27 
 
 		 3602 aa  51.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.44 
 
 		 2121 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.17 
 
 		 2489 aa  51.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  35.35 
 
 		 1263 aa  50.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.8 
 
 		 3191 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1537 aa  50.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.84 
 
 		 2520 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  25.4 
 
 		 702 aa  51.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1702 aa  48.5  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000062  hypothetical protein  26.7 
 
 		 396 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.738723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  26.93 
 
 		 3920 aa  48.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  36.46 
 
 		 409 aa  48.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1665 aa  48.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  28.5 
 
 		 713 aa  47.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  25.33 
 
 		 801 aa  47  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  24.71 
 
 		 1857 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>