13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1517 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  100 
 
 
1230 aa  2478    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  84.21 
 
 
1482 aa  1597    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.39 
 
 
1469 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  49.19 
 
 
1236 aa  443  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  40.94 
 
 
1482 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  28.77 
 
 
2412 aa  161  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  27.73 
 
 
1285 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  30.43 
 
 
1898 aa  77.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  35.57 
 
 
1441 aa  70.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  26.15 
 
 
900 aa  64.3  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  26.1 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  30.39 
 
 
621 aa  58.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  25.32 
 
 
1946 aa  57.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>