71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0406 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 2418 aa  4895    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  63.3 
 
 		 2434 aa  3018    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1757 aa  579  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1580 aa  442  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29 
 
 		 2000 aa  290  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.32 
 
 		 1984 aa  270  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2118 aa  256  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1702 aa  173  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1278 aa  160  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  23.35 
 
 		 1402 aa  116  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1809 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1260 aa  102  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1260 aa  102  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  27.96 
 
 		 2853 aa  94.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  27.23 
 
 		 2886 aa  86.7  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  35.05 
 
 		 3486 aa  83.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 		 1700 aa  78.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 1709 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  26.51 
 
 		 509 aa  70.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1175 aa  69.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1175 aa  68.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1063 aa  67.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1861 aa  67.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  25.51 
 
 		 898 aa  67.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.22 
 
 		 3634 aa  66.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1214 aa  63.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  31.56 
 
 		 897 aa  62.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1946 aa  62.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 924 aa  61.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1222 aa  60.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.19 
 
 		 3324 aa  60.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  23.28 
 
 		 1861 aa  60.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1898 aa  59.7  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1441 aa  59.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  30.26 
 
 		 5010 aa  58.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  33.91 
 
 		 5017 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  33.91 
 
 		 5017 aa  58.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  33.91 
 
 		 5017 aa  57.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  33.91 
 
 		 5017 aa  57.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  30.07 
 
 		 5017 aa  56.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1140 aa  56.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  27.08 
 
 		 909 aa  55.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  24.74 
 
 		 2233 aa  54.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  33.02 
 
 		 2121 aa  53.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  32.32 
 
 		 5010 aa  53.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  33.02 
 
 		 1857 aa  53.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  34.34 
 
 		 5010 aa  53.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  40.85 
 
 		 5010 aa  53.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3360 aa  53.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  28.65 
 
 		 3771 aa  53.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2490 aa  52  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  26.2 
 
 		 2078 aa  51.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  31.43 
 
 		 2520 aa  51.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.85 
 
 		 2490 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  39.68 
 
 		 2520 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  26.89 
 
 		 621 aa  50.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.85 
 
 		 2485 aa  49.7  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.5 
 
 		 2490 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2358 aa  48.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.79 
 
 		 5745 aa  48.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2490 aa  48.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.59 
 
 		 1533 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.53 
 
 		 2490 aa  48.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2358 aa  48.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1514  hypothetical protein  27.11 
 
 		 372 aa  48.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0844616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  29.31 
 
 		 2490 aa  47.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  27.34 
 
 		 2489 aa  47  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  34.85 
 
 		 977 aa  47.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  28.44 
 
 		 2113 aa  46.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  40.74 
 
 		 429 aa  46.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.85 
 
 		 2487 aa  46.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>