20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1509 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1465    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  66.57 
 
 
719 aa  980    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  80.17 
 
 
713 aa  1151    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  42.11 
 
 
702 aa  542  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  41.86 
 
 
667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  40.08 
 
 
703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  40.61 
 
 
702 aa  472  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  48.51 
 
 
621 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  34.21 
 
 
703 aa  238  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  32.87 
 
 
562 aa  144  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  26.33 
 
 
561 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  31.44 
 
 
549 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  43.75 
 
 
669 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  40.14 
 
 
153 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  38.25 
 
 
1898 aa  95.1  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.54 
 
 
1003 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.5 
 
 
1147 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  25.81 
 
 
1441 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  31.52 
 
 
808 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  23.91 
 
 
757 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>