23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000485 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1360    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  57.91 
 
 		 703 aa  753    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  67.12 
 
 		 702 aa  928    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  43.49 
 
 		 719 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  41.72 
 
 		 702 aa  492  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  41.86 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  40.35 
 
 		 713 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  40.6 
 
 		 621 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  35.29 
 
 		 703 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  76.47 
 
 		 153 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  35.46 
 
 		 562 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  32.55 
 
 		 549 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1898 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  29.92 
 
 		 561 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  44.63 
 
 		 669 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1003 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06249  hypothetical protein  62.5 
 
 		 48 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1147 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  24.36 
 
 		 757 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1441 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1946 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1669  hypothetical protein  23.95 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.435445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  38.89 
 
 		 924 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>