18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5942 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 2412 aa  4730    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  59.25 
 
 		 1285 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1482 aa  283  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1482 aa  185  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  40.7 
 
 		 1441 aa  176  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1230 aa  162  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1469 aa  146  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1236 aa  145  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  37.64 
 
 		 3209 aa  98.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  27.38 
 
 		 900 aa  94  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  29.25 
 
 		 1129 aa  79.7  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  27.57 
 
 		 643 aa  78.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5163  hypothetical protein  32.63 
 
 		 746 aa  68.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  29.56 
 
 		 977 aa  61.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1521  conserved repeat domain protein  30.5 
 
 		 435 aa  56.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000177441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  28.68 
 
 		 435 aa  55.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 1989 aa  49.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5944  conserved repeat domain protein  28.29 
 
 		 969 aa  48.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>