16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3138 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  85.26 
 
 
1236 aa  1748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  97.98 
 
 
1482 aa  891    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
1469 aa  2914    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  50.81 
 
 
1230 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  50.81 
 
 
1482 aa  476  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  31.41 
 
 
2412 aa  162  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2003  Ig-like protein  33.21 
 
 
462 aa  131  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0653567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  28.74 
 
 
1285 aa  125  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  38.18 
 
 
694 aa  121  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  27.47 
 
 
1129 aa  87.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0385  protein of unknown function DUF1555  30.89 
 
 
343 aa  87  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1064  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.07 
 
 
2064 aa  87  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.192438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 
900 aa  78.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  24.85 
 
 
643 aa  53.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  36.76 
 
 
5517 aa  45.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.58 
 
 
1628 aa  45.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>