13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2003 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2003  Ig-like protein  100 
 
 
462 aa  920    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0653567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  40.07 
 
 
694 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.21 
 
 
1469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0385  protein of unknown function DUF1555  34.3 
 
 
343 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2441  hypothetical protein  75 
 
 
193 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0886  hypothetical protein  66.67 
 
 
208 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  74.07 
 
 
275 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5958  Ig domain protein group 1 domain protein  35.05 
 
 
488 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0513  hypothetical protein  67.86 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0714  hypothetical protein  67.86 
 
 
167 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0060  hypothetical protein  50 
 
 
468 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  60.71 
 
 
444 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0649  hypothetical protein  58.62 
 
 
193 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>