14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2719 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 435 aa  868    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1521  conserved repeat domain protein  88.97 
 
 		 435 aa  716    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000177441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  29.89 
 
 		 996 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  30.6 
 
 		 2412 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  30.46 
 
 		 966 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  30.46 
 
 		 1030 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  23.01 
 
 		 880 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  32.04 
 
 		 3921 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  33.15 
 
 		 1984 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  31.85 
 
 		 1129 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  24.86 
 
 		 977 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 		 848 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  32.07 
 
 		 2000 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1702 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>