40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1328 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  100 
 
 		 1702 aa  3384    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  36.57 
 
 		 2118 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1757 aa  251  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  34.73 
 
 		 2000 aa  222  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29.73 
 
 		 1984 aa  218  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  24.62 
 
 		 2434 aa  183  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  30.65 
 
 		 2418 aa  178  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1580 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1278 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1260 aa  120  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1260 aa  120  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  28.91 
 
 		 1402 aa  118  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 		 1700 aa  102  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  28.1 
 
 		 1709 aa  99.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1140 aa  89  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1175 aa  85.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1175 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1946 aa  69.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  27 
 
 		 2233 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1809 aa  66.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  30.42 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1171 aa  63.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  25.31 
 
 		 2853 aa  62  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  30.53 
 
 		 2886 aa  58.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  28.4 
 
 		 689 aa  55.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.14 
 
 		 898 aa  54.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.73 
 
 		 924 aa  54.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1222 aa  52.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  29.61 
 
 		 3486 aa  52.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1143 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  25.74 
 
 		 2025 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1171 aa  51.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.25 
 
 		 3634 aa  50.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1898 aa  50.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1441 aa  50.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  26.25 
 
 		 2078 aa  50.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  29.53 
 
 		 3521 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  25 
 
 		 3472 aa  46.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  28.86 
 
 		 3471 aa  47  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  24.07 
 
 		 1248 aa  46.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>