88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0435 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 2886 aa  5703    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  76.94 
 
 		 2853 aa  4357    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1809 aa  384  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1441 aa  261  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  42.5 
 
 		 1898 aa  261  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1946 aa  257  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  39.4 
 
 		 3486 aa  201  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  38.74 
 
 		 3634 aa  200  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  38.74 
 
 		 2078 aa  199  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.67 
 
 		 1857 aa  111  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.9 
 
 		 2113 aa  108  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.25 
 
 		 2121 aa  107  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2490 aa  105  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.73 
 
 		 1533 aa  104  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  31.69 
 
 		 2490 aa  98.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2489 aa  97.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.81 
 
 		 2490 aa  98.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  28.03 
 
 		 2520 aa  98.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  31.29 
 
 		 2485 aa  97.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29.47 
 
 		 1984 aa  97.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.32 
 
 		 2520 aa  95.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27 
 
 		 2434 aa  94.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  28.84 
 
 		 2000 aa  93.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1624 aa  93.2  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  27.43 
 
 		 975 aa  92.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.81 
 
 		 5010 aa  92  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.91 
 
 		 2487 aa  91.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  25.45 
 
 		 5203 aa  91.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.22 
 
 		 2490 aa  91.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  32.73 
 
 		 2118 aa  89.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.96 
 
 		 939 aa  88.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2358 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.25 
 
 		 2358 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.69 
 
 		 5010 aa  86.7  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  27.23 
 
 		 2418 aa  86.3  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  26.98 
 
 		 5010 aa  85.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  25.53 
 
 		 1108 aa  85.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 5017 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.89 
 
 		 5017 aa  83.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.89 
 
 		 5017 aa  83.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  29.04 
 
 		 5166 aa  82.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  26.92 
 
 		 5010 aa  82.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.97 
 
 		 2490 aa  82.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.05 
 
 		 5017 aa  82  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 		 4897 aa  80.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.26 
 
 		 2490 aa  79.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  26.4 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  45 
 
 		 3771 aa  79.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1757 aa  76.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  42.5 
 
 		 3360 aa  75.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.2 
 
 		 3714 aa  74.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  26.7 
 
 		 5017 aa  73.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.83 
 
 		 3816 aa  73.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1580 aa  72.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 		 1293 aa  72  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.1 
 
 		 8918 aa  71.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.6 
 
 		 1118 aa  68.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.94 
 
 		 924 aa  68.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  25.12 
 
 		 3394 aa  67  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.05 
 
 		 4896 aa  66.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  26.93 
 
 		 3911 aa  65.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  24.26 
 
 		 3508 aa  65.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.85 
 
 		 2724 aa  61.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  27.32 
 
 		 2233 aa  60.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  26.45 
 
 		 509 aa  58.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1202 aa  58.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1702 aa  58.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.64 
 
 		 3602 aa  57.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1214 aa  57  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  21.43 
 
 		 2025 aa  56.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  22.15 
 
 		 3472 aa  55.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1537 aa  55.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  40.22 
 
 		 900 aa  55.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.4 
 
 		 898 aa  53.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  21.32 
 
 		 3471 aa  53.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  31.02 
 
 		 689 aa  53.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  21.53 
 
 		 3521 aa  52.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  28.04 
 
 		 621 aa  52.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.82 
 
 		 3409 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  24.05 
 
 		 2573 aa  51.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  26.48 
 
 		 1129 aa  50.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1624  ABC-type sugar transport systems permease components-like protein  40 
 
 		 503 aa  49.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  30.83 
 
 		 909 aa  49.7  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0868  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.16 
 
 		 456 aa  49.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  29.32 
 
 		 2395 aa  48.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.57 
 
 		 2656 aa  47  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36570  conserved repeat protein  25 
 
 		 1923 aa  46.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.27 
 
 		 1519 aa  46.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>