142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3573 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  34.67 
 
 
2078 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  100 
 
 
3486 aa  6778    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  32.41 
 
 
8918 aa  776    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  34.4 
 
 
3634 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.35 
 
 
1989 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.98 
 
 
4896 aa  302  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  34.58 
 
 
2912 aa  251  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  34.81 
 
 
1946 aa  235  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  33.06 
 
 
1898 aa  233  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  40.57 
 
 
1441 aa  231  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  40.4 
 
 
2853 aa  206  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  39.4 
 
 
2886 aa  202  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  37.92 
 
 
1809 aa  201  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  29.44 
 
 
3920 aa  160  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.68 
 
 
2358 aa  94  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.68 
 
 
2358 aa  93.2  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  50 
 
 
3360 aa  87.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  47.37 
 
 
3771 aa  84  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  37.43 
 
 
801 aa  83.2  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  35.05 
 
 
2418 aa  82.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  33.49 
 
 
2434 aa  82  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  33.33 
 
 
1665 aa  75.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 
4897 aa  75.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.19 
 
 
898 aa  75.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.6 
 
 
3793 aa  73.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  30.74 
 
 
909 aa  73.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  28.44 
 
 
2604 aa  72.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.59 
 
 
5017 aa  72  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.76 
 
 
2490 aa  72.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.07 
 
 
5017 aa  71.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.07 
 
 
5017 aa  71.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.07 
 
 
5017 aa  71.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.57 
 
 
2490 aa  70.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  33.89 
 
 
2118 aa  70.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  28.24 
 
 
2000 aa  70.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.6 
 
 
2490 aa  69.7  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  28.77 
 
 
983 aa  68.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.87 
 
 
2485 aa  69.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.88 
 
 
5017 aa  67.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  29.55 
 
 
509 aa  66.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.01 
 
 
1984 aa  65.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  28.81 
 
 
1580 aa  65.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.92 
 
 
2114 aa  65.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  43.1 
 
 
4978 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.34 
 
 
5010 aa  63.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  47.92 
 
 
892 aa  63.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.67 
 
 
2489 aa  63.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.23 
 
 
2490 aa  63.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  43.62 
 
 
653 aa  63.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  45.45 
 
 
4748 aa  62.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.99 
 
 
5010 aa  62.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  65.31 
 
 
1706 aa  62  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.6 
 
 
2490 aa  61.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 
440 aa  60.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  42.7 
 
 
1021 aa  58.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  40.59 
 
 
1518 aa  58.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  41.77 
 
 
3927 aa  58.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  43.75 
 
 
721 aa  58.2  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  42.55 
 
 
653 aa  57.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  42.86 
 
 
3191 aa  57.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25 
 
 
2520 aa  57  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.39 
 
 
8321 aa  57.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  41.94 
 
 
974 aa  57  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  32.74 
 
 
2487 aa  56.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.81 
 
 
2121 aa  55.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  24.45 
 
 
2113 aa  56.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  41.11 
 
 
653 aa  55.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  40.57 
 
 
2816 aa  56.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.08 
 
 
1712 aa  56.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  25.28 
 
 
2520 aa  55.5  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 
1287 aa  55.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  39.8 
 
 
2602 aa  55.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  31.96 
 
 
2490 aa  55.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  32.68 
 
 
1394 aa  55.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.68 
 
 
850 aa  54.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  25.35 
 
 
1857 aa  54.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.06 
 
 
1118 aa  54.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  30.88 
 
 
702 aa  54.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  49.21 
 
 
1022 aa  53.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.33 
 
 
1109 aa  53.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  25.83 
 
 
1533 aa  53.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  40.62 
 
 
1141 aa  53.5  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  25.92 
 
 
3471 aa  53.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  42.7 
 
 
2887 aa  53.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  36.28 
 
 
1597 aa  53.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.62 
 
 
761 aa  53.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.62 
 
 
994 aa  52.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28.1 
 
 
1757 aa  52  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  29.61 
 
 
1702 aa  52  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.93 
 
 
5745 aa  51.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  36.97 
 
 
1215 aa  52  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  36.97 
 
 
1215 aa  52  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.17 
 
 
2542 aa  52  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  31.4 
 
 
429 aa  51.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_205  hypothetical protein  31.61 
 
 
653 aa  51.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.84 
 
 
3363 aa  51.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.36 
 
 
1066 aa  51.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  35.58 
 
 
1367 aa  51.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  36.08 
 
 
157 aa  51.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  43.43 
 
 
5769 aa  51.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>