37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4949 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1026    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  29.17 
 
 
1757 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.6 
 
 
2000 aa  94.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  28.34 
 
 
2118 aa  90.5  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  29.41 
 
 
1580 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  27.35 
 
 
1441 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  27.68 
 
 
1984 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  28.19 
 
 
2853 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.82 
 
 
2434 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  29.44 
 
 
1946 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.87 
 
 
1898 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  28.69 
 
 
1809 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  27.9 
 
 
689 aa  70.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  26.51 
 
 
2418 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  29.55 
 
 
3486 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  30.42 
 
 
1702 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.97 
 
 
3634 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  25.46 
 
 
898 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  26.97 
 
 
2078 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  26.45 
 
 
2886 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  25.96 
 
 
924 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  25.37 
 
 
900 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  29.07 
 
 
4897 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  32.06 
 
 
2520 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  24.86 
 
 
3771 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  35.64 
 
 
2520 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  38.38 
 
 
983 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.1 
 
 
8918 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  35.4 
 
 
2121 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  50 
 
 
2713 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  28.57 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.1 
 
 
1533 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  31.43 
 
 
2485 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  45.83 
 
 
1857 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.1 
 
 
2113 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  23.47 
 
 
3360 aa  43.5  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  27.52 
 
 
5203 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>