105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01568 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  43.14 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  41.88 
 
 		 892 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  37.6 
 
 		 3927 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.45 
 
 		 1884 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  46.15 
 
 		 2542 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.22 
 
 		 2377 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  49.33 
 
 		 1867 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  43.88 
 
 		 2816 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.86 
 
 		 1712 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  42.7 
 
 		 1141 aa  61.2  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  39.09 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  43.07 
 
 		 721 aa  61.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 		 2114 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.96 
 
 		 1706 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  40 
 
 		 1597 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  41.49 
 
 		 1022 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  39.68 
 
 		 4978 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  41.49 
 
 		 5745 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 		 2346 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.01 
 
 		 761 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.32 
 
 		 994 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.56 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  44.32 
 
 		 1268 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  44.32 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  45.35 
 
 		 1269 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  42.57 
 
 		 1215 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  42.57 
 
 		 1215 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 850 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 2074 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1781 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1416 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.48 
 
 		 2507 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  38.71 
 
 		 653 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  33.04 
 
 		 511 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.39 
 
 		 4220 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  36.08 
 
 		 3486 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  43.02 
 
 		 1269 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 3474 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  40 
 
 		 584 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  40 
 
 		 584 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  40 
 
 		 581 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  41.3 
 
 		 2153 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  44.26 
 
 		 1518 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.05 
 
 		 777 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  42.19 
 
 		 4231 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 		 1215 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  35.56 
 
 		 974 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 		 1215 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  39.6 
 
 		 1215 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1538 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  38.54 
 
 		 3477 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  37.97 
 
 		 613 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1512 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  50.91 
 
 		 909 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1752 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  41.33 
 
 		 2924 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1066 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  47.54 
 
 		 877 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  37.5 
 
 		 653 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  35.42 
 
 		 653 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 885 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  35.44 
 
 		 569 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  35.96 
 
 		 556 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.51 
 
 		 2839 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 		 1287 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.78 
 
 		 846 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.86 
 
 		 1109 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  34.41 
 
 		 1394 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  46.81 
 
 		 594 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  36.67 
 
 		 4854 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  32.99 
 
 		 663 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  37.97 
 
 		 601 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.62 
 
 		 1949 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  37.08 
 
 		 16322 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.17 
 
 		 1056 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1126 aa  44.3  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.64 
 
 		 802 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 		 1433 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.33 
 
 		 880 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1067 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.47 
 
 		 4687 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  48.15 
 
 		 2767 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.1 
 
 		 3363 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  53.33 
 
 		 814 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1006 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  39.47 
 
 		 4896 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1750 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.66 
 
 		 2305 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 934 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  40.43 
 
 		 3191 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  38.55 
 
 		 755 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  47.17 
 
 		 2192 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.46 
 
 		 8321 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  36.84 
 
 		 567 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.38 
 
 		 2281 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  35.35 
 
 		 4748 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  53.33 
 
 		 4848 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  39.24 
 
 		 7284 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 3259 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>