101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2349 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 974 aa  1966    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.63 
 
 		 3191 aa  99  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38.12 
 
 		 4978 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  48.67 
 
 		 2816 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 		 2114 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.74 
 
 		 3816 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1416 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.54 
 
 		 1597 aa  75.1  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1512 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.34 
 
 		 5745 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1518 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  42.62 
 
 		 3477 aa  70.1  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.94 
 
 		 1109 aa  69.7  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  40 
 
 		 2698 aa  68.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  38.58 
 
 		 1141 aa  68.6  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  41 
 
 		 1066 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.57 
 
 		 2377 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1538 aa  66.6  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  41.18 
 
 		 3474 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  34.58 
 
 		 663 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  38.52 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  39.81 
 
 		 2153 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  31.84 
 
 		 1867 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 1287 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 		 994 aa  60.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  38.46 
 
 		 1022 aa  60.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.04 
 
 		 2346 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  42.72 
 
 		 1668 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.82 
 
 		 2807 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1781 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.55 
 
 		 3363 aa  58.9  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  36.36 
 
 		 1706 aa  58.9  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.27 
 
 		 4896 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.78 
 
 		 1268 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.89 
 
 		 3927 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  30.81 
 
 		 715 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  32.56 
 
 		 1269 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  41.94 
 
 		 3486 aa  57  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.42 
 
 		 1283 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  39 
 
 		 1367 aa  56.6  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.8 
 
 		 1884 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  47.89 
 
 		 16322 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  35.54 
 
 		 4848 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  53.57 
 
 		 2074 aa  56.2  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1752 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  40 
 
 		 2267 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 982 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1006 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  42.71 
 
 		 1744 aa  54.7  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  39.78 
 
 		 653 aa  54.7  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  42.11 
 
 		 1269 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  39.81 
 
 		 1394 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  37.76 
 
 		 2602 aa  54.7  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  31.01 
 
 		 653 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  37.08 
 
 		 316 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  30.67 
 
 		 2353 aa  54.3  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.88 
 
 		 2839 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.6 
 
 		 4854 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 369 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  38.26 
 
 		 5769 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  28.48 
 
 		 2145 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1712 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  31.4 
 
 		 653 aa  52  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  34.74 
 
 		 2767 aa  51.6  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2141  hypothetical protein  29.6 
 
 		 744 aa  51.6  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 2555 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.76 
 
 		 16311 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  46.27 
 
 		 892 aa  51.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  35.19 
 
 		 4231 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1058 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.12 
 
 		 846 aa  50.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1131 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  32 
 
 		 601 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 3954 aa  49.3  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  36.36 
 
 		 157 aa  49.7  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1879 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  33.05 
 
 		 1363 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.03 
 
 		 4122 aa  49.3  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  42.11 
 
 		 8321 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.08 
 
 		 1286 aa  48.9  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  26.9 
 
 		 877 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  32.74 
 
 		 1131 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  40 
 
 		 3089 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.62 
 
 		 2507 aa  47.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.86 
 
 		 4220 aa  47.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  39.24 
 
 		 3471 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  38.46 
 
 		 582 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  40 
 
 		 1035 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  37.04 
 
 		 4748 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.74 
 
 		 1502 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  32.09 
 
 		 2542 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  35.21 
 
 		 5444 aa  46.2  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4616  hypothetical protein  36.46 
 
 		 284 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.11 
 
 		 814 aa  45.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.78 
 
 		 1673 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  37.63 
 
 		 2478 aa  45.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.64 
 
 		 2503 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>