48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0863 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  100 
 
 
1058 aa  2134    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  65.88 
 
 
613 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  49.55 
 
 
584 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  49.55 
 
 
584 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  49.1 
 
 
581 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  42.81 
 
 
569 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  50.61 
 
 
601 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  35.25 
 
 
342 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.56 
 
 
815 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  36.42 
 
 
906 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  29.48 
 
 
909 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.8 
 
 
880 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  28.74 
 
 
997 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  49.33 
 
 
1867 aa  65.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 
885 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.28 
 
 
5745 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  39.39 
 
 
585 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.91 
 
 
4978 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  25.59 
 
 
792 aa  58.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.93 
 
 
2305 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  42.86 
 
 
3927 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  41.07 
 
 
2377 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  29.35 
 
 
3378 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  27.91 
 
 
565 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  35.51 
 
 
910 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  38.89 
 
 
1416 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  34.62 
 
 
180 aa  52.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 
934 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  53.33 
 
 
1597 aa  52.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.67 
 
 
1712 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  53.06 
 
 
1141 aa  52  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
1884 aa  51.6  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  50 
 
 
666 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  34.04 
 
 
974 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.83 
 
 
2114 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 
1433 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.11 
 
 
1056 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  34.78 
 
 
927 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  46 
 
 
1512 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  29.25 
 
 
139 aa  48.5  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  44.83 
 
 
2542 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  25.61 
 
 
2310 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.25 
 
 
4798 aa  46.2  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 
1063 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  44 
 
 
4231 aa  45.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  35.64 
 
 
3699 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  40.38 
 
 
4896 aa  45.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.64 
 
 
3699 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>