80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1297 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  361  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  44.12 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.05 
 
 		 850 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.07 
 
 		 994 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  38.05 
 
 		 1867 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.05 
 
 		 761 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.23 
 
 		 2377 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  45.68 
 
 		 1141 aa  62  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 		 2074 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.45 
 
 		 892 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.79 
 
 		 3927 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  37.84 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  33.61 
 
 		 2542 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 4978 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.47 
 
 		 1884 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  37.84 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  37.33 
 
 		 2924 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1512 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  40 
 
 		 1416 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 369 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  38.46 
 
 		 909 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 		 2507 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.27 
 
 		 2114 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  36.26 
 
 		 2153 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.66 
 
 		 1750 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1058 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.08 
 
 		 1706 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  37.84 
 
 		 584 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  37.84 
 
 		 581 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  38.37 
 
 		 715 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  37.84 
 
 		 584 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  41.56 
 
 		 721 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  32.43 
 
 		 613 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.94 
 
 		 11716 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  32.22 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  42.67 
 
 		 2816 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  39.51 
 
 		 906 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  42.68 
 
 		 815 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.68 
 
 		 1712 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1949 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 934 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34 
 
 		 1066 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 885 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  33.58 
 
 		 516 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.1 
 
 		 777 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.09 
 
 		 4687 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 846 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  45 
 
 		 2305 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  30.61 
 
 		 663 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  38.46 
 
 		 666 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27866  predicted protein  35.62 
 
 		 3182 aa  45.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.01 
 
 		 5745 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  39.68 
 
 		 974 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  43.55 
 
 		 910 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.11 
 
 		 4798 aa  45.1  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.58 
 
 		 1779 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.29 
 
 		 3474 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  39.22 
 
 		 4231 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  27.12 
 
 		 556 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  43.55 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1006 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.21 
 
 		 1597 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  40.58 
 
 		 3486 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  36 
 
 		 1022 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.66 
 
 		 1433 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.44 
 
 		 1063 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5577  cysteine-rich repeat protein  25.6 
 
 		 511 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.91 
 
 		 802 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  33.33 
 
 		 2656 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  38.46 
 
 		 4848 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  41.67 
 
 		 997 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.57 
 
 		 3363 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.25 
 
 		 4220 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  40.32 
 
 		 880 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1752 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  43.1 
 
 		 570 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  25.34 
 
 		 1363 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3045  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.1 
 
 		 703 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267521  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1781 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  34.41 
 
 		 1502 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>