31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5042 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  100 
 
 
906 aa  1817    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.5 
 
 
880 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  38.73 
 
 
910 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  36.42 
 
 
1058 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  40.59 
 
 
815 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  43.33 
 
 
997 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  36.55 
 
 
934 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 
885 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  43.68 
 
 
613 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  34.13 
 
 
601 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  32.72 
 
 
898 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  41.51 
 
 
569 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  30.65 
 
 
2305 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  40.48 
 
 
1867 aa  55.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  35.85 
 
 
584 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  35.85 
 
 
581 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  35.85 
 
 
584 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  39.51 
 
 
180 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.64 
 
 
2114 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  43.55 
 
 
1141 aa  48.9  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  38.68 
 
 
2816 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  43.75 
 
 
1416 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  25.16 
 
 
565 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  45.1 
 
 
1512 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  43.55 
 
 
2377 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.07 
 
 
1056 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.66 
 
 
1063 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.65 
 
 
777 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.32 
 
 
3927 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  37.62 
 
 
927 aa  44.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  41.82 
 
 
4978 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>