111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01543 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  44 
 
 		 1884 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  43.88 
 
 		 3927 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.69 
 
 		 2542 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 1867 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  40.26 
 
 		 613 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  39.09 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  40.62 
 
 		 892 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  43.84 
 
 		 2816 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  45.88 
 
 		 715 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 2507 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  41.38 
 
 		 2377 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36.11 
 
 		 3474 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 4978 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.22 
 
 		 5745 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  43.96 
 
 		 3477 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 1141 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.07 
 
 		 4798 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.59 
 
 		 3816 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  43.42 
 
 		 584 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  43.42 
 
 		 584 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 		 994 aa  53.9  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  43.42 
 
 		 581 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  40.21 
 
 		 2074 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1512 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  31.43 
 
 		 569 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  49.12 
 
 		 4231 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  41.38 
 
 		 1269 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  40.79 
 
 		 601 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.44 
 
 		 2114 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.45 
 
 		 1268 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  32.85 
 
 		 877 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 850 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.45 
 
 		 1109 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.66 
 
 		 369 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  32.22 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  38.2 
 
 		 2839 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.08 
 
 		 761 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.64 
 
 		 1063 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  36.63 
 
 		 2153 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  38.2 
 
 		 1269 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  42.11 
 
 		 567 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1058 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  52.38 
 
 		 666 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  38.95 
 
 		 814 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.94 
 
 		 1599 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  42.03 
 
 		 1321 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  37.62 
 
 		 2353 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  32.99 
 
 		 1911 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.78 
 
 		 2503 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1416 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  38.78 
 
 		 3699 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  49.06 
 
 		 1706 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.78 
 
 		 3544 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  36.05 
 
 		 2522 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.93 
 
 		 5094 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1750 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  32.5 
 
 		 755 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  39.44 
 
 		 1597 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.96 
 
 		 3089 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.34 
 
 		 1433 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 		 1283 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.77 
 
 		 585 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  39.74 
 
 		 909 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.62 
 
 		 4848 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  37.63 
 
 		 3182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1712 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.46 
 
 		 3363 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.74 
 
 		 777 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1292 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2611  hypothetical protein  36.84 
 
 		 2924 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.34 
 
 		 1056 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.73 
 
 		 3699 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 1286 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  35.29 
 
 		 721 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  38.46 
 
 		 3486 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  40.37 
 
 		 5020 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 885 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  40.68 
 
 		 1035 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2767 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  44.26 
 
 		 653 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 		 2239 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  36.05 
 
 		 7284 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.02 
 
 		 4854 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  36.05 
 
 		 2636 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  45.83 
 
 		 8321 aa  42.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.83 
 
 		 2476 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.63 
 
 		 2192 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  37.84 
 
 		 1779 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.73 
 
 		 4687 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  32.71 
 
 		 1215 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.71 
 
 		 1215 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.84 
 
 		 1949 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 934 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  55.26 
 
 		 2310 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.68 
 
 		 3396 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  39.42 
 
 		 16322 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34.69 
 
 		 2768 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  46.94 
 
 		 653 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  42.86 
 
 		 1022 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>