43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0864 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1140    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  51.15 
 
 		 581 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  50.68 
 
 		 584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  50.68 
 
 		 584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  51.6 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  47.39 
 
 		 1058 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  43.08 
 
 		 613 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  37.21 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  33.7 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  31.58 
 
 		 997 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  30.91 
 
 		 880 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  29.81 
 
 		 909 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  47.56 
 
 		 1867 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  31.39 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  46.32 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.64 
 
 		 2305 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  42.17 
 
 		 3927 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1416 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  41.96 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  25.96 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  49.18 
 
 		 1512 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  39.33 
 
 		 4978 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  47.37 
 
 		 2377 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.74 
 
 		 5745 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.48 
 
 		 1884 aa  53.9  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  31.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 885 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  36.94 
 
 		 910 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.96 
 
 		 1949 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25.33 
 
 		 4798 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  48.33 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  43.55 
 
 		 1046 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  35.44 
 
 		 157 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  50 
 
 		 1597 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.37 
 
 		 2542 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 4231 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.13 
 
 		 2114 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  35.63 
 
 		 2310 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.38 
 
 		 1141 aa  44.3  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.35 
 
 		 1712 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.19 
 
 		 1063 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4132  hypothetical protein  32.73 
 
 		 516 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0019999  decreased coverage  0.00477797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>