49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1456 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  100 
 
 
792 aa  1566    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  71.75 
 
 
998 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  54.64 
 
 
1004 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  32.32 
 
 
845 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5463  hypothetical protein  32.27 
 
 
884 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  47.71 
 
 
940 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  35.75 
 
 
331 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  39.2 
 
 
2002 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  39.11 
 
 
835 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.5 
 
 
726 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3188  protease-associated PA  27.58 
 
 
567 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3304  protease-associated PA domain protein  27.59 
 
 
567 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  53.85 
 
 
1076 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  48.94 
 
 
2117 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  48.31 
 
 
4357 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  28.69 
 
 
1390 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  34.5 
 
 
841 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  36.67 
 
 
582 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  50.62 
 
 
1263 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  46.23 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  48.81 
 
 
1027 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  47.56 
 
 
720 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  50 
 
 
2082 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  32.35 
 
 
342 aa  67.4  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  37.35 
 
 
864 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  36.69 
 
 
1081 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  56.14 
 
 
607 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  43.37 
 
 
514 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.47 
 
 
1323 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  37.5 
 
 
708 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.55 
 
 
1095 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  25.96 
 
 
569 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  25.59 
 
 
1058 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  28 
 
 
601 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  48.75 
 
 
665 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  27.04 
 
 
584 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  27.04 
 
 
584 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  41.25 
 
 
1222 aa  55.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  47.06 
 
 
321 aa  55.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  26.53 
 
 
581 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  45.57 
 
 
608 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  35.83 
 
 
750 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  39.24 
 
 
917 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  40.79 
 
 
848 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.6 
 
 
717 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  46.99 
 
 
839 aa  50.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
797 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  23.27 
 
 
613 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4133  hypothetical protein  28.72 
 
 
406 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393583  decreased coverage  0.00385756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>