125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0780 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 909 aa  1834    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  49.61 
 
 		 585 aa  102  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1667 aa  89  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.86 
 
 		 810 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.84 
 
 		 2114 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.54 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  37.7 
 
 		 898 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.08 
 
 		 387 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  43.62 
 
 		 910 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.47 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.03 
 
 		 819 aa  67.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  37.74 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  28.18 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.57 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  37.82 
 
 		 934 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  42.53 
 
 		 601 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  39.36 
 
 		 880 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.3 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  43.96 
 
 		 2305 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1058 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  41.82 
 
 		 791 aa  62  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.28 
 
 		 580 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.63 
 
 		 327 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  41.11 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.08 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.03 
 
 		 1364 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  38.6 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  38.6 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  44.83 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.91 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.64 
 
 		 971 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 1867 aa  58.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.61 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 		 366 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  27.23 
 
 		 408 aa  57.4  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.91 
 
 		 327 aa  57.4  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  26.74 
 
 		 334 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  26.15 
 
 		 314 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.32 
 
 		 1523 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  26.87 
 
 		 306 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  26.03 
 
 		 312 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.38 
 
 		 652 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 		 752 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  54.7  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 		 320 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.53 
 
 		 1454 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 344 aa  54.7  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.75 
 
 		 370 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.2 
 
 		 406 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.34 
 
 		 1433 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.37 
 
 		 2377 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.92 
 
 		 328 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 312 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 		 335 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.84 
 
 		 334 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.68 
 
 		 320 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.92 
 
 		 328 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.7 
 
 		 328 aa  52.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.89 
 
 		 330 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.98 
 
 		 1884 aa  52  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.1 
 
 		 328 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  25.86 
 
 		 1189 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.27 
 
 		 660 aa  51.6  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.53 
 
 		 391 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.53 
 
 		 326 aa  51.2  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2224  hypothetical protein  53.49 
 
 		 998 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.96 
 
 		 1063 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.22 
 
 		 348 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  41.86 
 
 		 2310 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.95 
 
 		 488 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1170 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.61 
 
 		 328 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.04 
 
 		 384 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.51 
 
 		 348 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.71 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.79 
 
 		 329 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.37 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1416 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.54 
 
 		 332 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 		 947 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.45 
 
 		 329 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  50.91 
 
 		 157 aa  48.9  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  45.16 
 
 		 3927 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.34 
 
 		 348 aa  48.5  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 607 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  35.8 
 
 		 426 aa  48.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.72 
 
 		 324 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0859  hypothetical protein  39.53 
 
 		 945 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0876  hypothetical protein  39.53 
 
 		 945 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1949 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0865  hypothetical protein  39.53 
 
 		 945 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  40.48 
 
 		 1712 aa  47.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.1 
 
 		 329 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 354 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>