96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0859 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 945 aa  1843    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 945 aa  1843    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0865  hypothetical protein  97.25 
 
 		 945 aa  1631    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.46 
 
 		 479 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1667 aa  92  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  30.62 
 
 		 819 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3498  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.99 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.29 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.78 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.12 
 
 		 1170 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.74 
 
 		 354 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.63 
 
 		 1094 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  31.69 
 
 		 387 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  30.94 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.36 
 
 		 327 aa  67  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.44 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.23 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.06 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  28.75 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.68 
 
 		 971 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.64 
 
 		 354 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 		 354 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.83 
 
 		 1949 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  29.81 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.46 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.29 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.24 
 
 		 366 aa  62  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  27.72 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1056 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.16 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.03 
 
 		 1357 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.28 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.13 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 		 347 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.91 
 
 		 1364 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  31.37 
 
 		 556 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.23 
 
 		 696 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.31 
 
 		 332 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2224  hypothetical protein  46.3 
 
 		 998 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 821 aa  54.7  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.65 
 
 		 919 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  35.38 
 
 		 3378 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.73 
 
 		 328 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1211 aa  52.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.97 
 
 		 406 aa  52  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  29.19 
 
 		 391 aa  52  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.72 
 
 		 1344 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.87 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.45 
 
 		 1217 aa  51.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 		 317 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.67 
 
 		 479 aa  50.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 1334 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.08 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.23 
 
 		 330 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.4 
 
 		 1063 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28 
 
 		 692 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.7 
 
 		 1240 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.59 
 
 		 328 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.27 
 
 		 328 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.06 
 
 		 312 aa  49.3  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 		 405 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.38 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 776 aa  48.5  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 		 652 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.82 
 
 		 383 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.51 
 
 		 338 aa  48.5  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28 
 
 		 327 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  39.53 
 
 		 909 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.1 
 
 		 661 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  30.91 
 
 		 215 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.76 
 
 		 675 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.25 
 
 		 1523 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1041 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 		 974 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  32 
 
 		 363 aa  47  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.52 
 
 		 318 aa  46.2  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  28.26 
 
 		 1189 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3031  hypothetical protein  32.41 
 
 		 366 aa  46.2  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  31.06 
 
 		 306 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 		 1088 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1367 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  28.03 
 
 		 408 aa  45.8  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.67 
 
 		 311 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.69 
 
 		 328 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.99 
 
 		 328 aa  45.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.05 
 
 		 943 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  24.6 
 
 		 639 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 1557 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.59 
 
 		 1652 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.63 
 
 		 335 aa  44.7  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 		 311 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.96 
 
 		 943 aa  44.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.67 
 
 		 394 aa  44.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>