208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0895 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  53.16 
 
 
954 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  43.81 
 
 
961 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  53.05 
 
 
954 aa  942    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  50 
 
 
991 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  53.16 
 
 
954 aa  935    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  47.35 
 
 
945 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  47.35 
 
 
945 aa  772    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  100 
 
 
946 aa  1939    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  41.15 
 
 
963 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.31 
 
 
829 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.46 
 
 
818 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  30.18 
 
 
916 aa  290  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.14 
 
 
911 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  29.65 
 
 
921 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  27.95 
 
 
873 aa  194  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.29 
 
 
931 aa  178  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  26.29 
 
 
931 aa  178  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  26.48 
 
 
928 aa  178  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.12 
 
 
962 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  25.12 
 
 
962 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0370  hypothetical protein  43.2 
 
 
284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.08 
 
 
819 aa  88.2  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  29.82 
 
 
479 aa  87.8  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  37.16 
 
 
1667 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.85 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.72 
 
 
810 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.14 
 
 
689 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.97 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  33.7 
 
 
580 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  35.95 
 
 
1189 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  35.14 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.81 
 
 
971 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  33.74 
 
 
335 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  26.79 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.96 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 
353 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.1 
 
 
328 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.95 
 
 
327 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.56 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.08 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.15 
 
 
391 aa  67.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.41 
 
 
328 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
328 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
776 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.36 
 
 
332 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.12 
 
 
334 aa  65.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.86 
 
 
366 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.94 
 
 
328 aa  65.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.83 
 
 
354 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 
329 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.09 
 
 
316 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 
329 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 
329 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.34 
 
 
330 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.5 
 
 
1056 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  26.64 
 
 
408 aa  63.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 
347 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  34.72 
 
 
335 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.54 
 
 
272 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.03 
 
 
328 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.36 
 
 
366 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
348 aa  62.4  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32 
 
 
417 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.92 
 
 
318 aa  62.4  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.72 
 
 
328 aa  62.4  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.52 
 
 
329 aa  62  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.54 
 
 
344 aa  61.6  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.17 
 
 
348 aa  61.2  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 
348 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.21 
 
 
345 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34 
 
 
336 aa  60.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0859  hypothetical protein  28.75 
 
 
945 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0876  hypothetical protein  28.75 
 
 
945 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.85 
 
 
457 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  30.28 
 
 
487 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.81 
 
 
517 aa  59.7  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.17 
 
 
313 aa  58.9  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0865  hypothetical protein  28.11 
 
 
945 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.07 
 
 
334 aa  59.3  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  29.8 
 
 
918 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.67 
 
 
318 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.99 
 
 
328 aa  58.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  58.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.12 
 
 
320 aa  58.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.3 
 
 
154 aa  57.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 
652 aa  57.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  28.26 
 
 
414 aa  57.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.45 
 
 
329 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.04 
 
 
192 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1767  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.11 
 
 
433 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  25.4 
 
 
381 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.03 
 
 
326 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.14 
 
 
310 aa  56.2  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.15 
 
 
314 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.88 
 
 
625 aa  55.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  36.07 
 
 
556 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 
323 aa  55.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.2 
 
 
821 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>