170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4335 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  100 
 
 
921 aa  1871    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.9 
 
 
911 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.38 
 
 
829 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.62 
 
 
818 aa  297  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  28.88 
 
 
916 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  31.72 
 
 
945 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  31.72 
 
 
945 aa  239  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  31.91 
 
 
954 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  31.91 
 
 
954 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  29.65 
 
 
946 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  30.2 
 
 
991 aa  221  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  31.74 
 
 
954 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  26.17 
 
 
873 aa  198  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  24.48 
 
 
928 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  28.28 
 
 
963 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.7 
 
 
962 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  24.7 
 
 
962 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  24.82 
 
 
931 aa  178  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.82 
 
 
931 aa  178  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  32.57 
 
 
961 aa  127  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.7 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.1 
 
 
479 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.11 
 
 
317 aa  66.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.91 
 
 
689 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.84 
 
 
1094 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  23.33 
 
 
918 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  31.43 
 
 
456 aa  61.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.85 
 
 
362 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  30.21 
 
 
438 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.15 
 
 
354 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  29.41 
 
 
534 aa  60.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.98 
 
 
366 aa  59.7  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.38 
 
 
1667 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  27.1 
 
 
465 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  31.53 
 
 
506 aa  58.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.35 
 
 
362 aa  57.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  33.54 
 
 
335 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.52 
 
 
327 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 
348 aa  57.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.3 
 
 
348 aa  57.4  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.47 
 
 
328 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.16 
 
 
335 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  29.41 
 
 
580 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  29.84 
 
 
560 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  30.09 
 
 
588 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  30.97 
 
 
554 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  30.09 
 
 
554 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  30.09 
 
 
554 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  30.09 
 
 
554 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  30.97 
 
 
566 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.71 
 
 
324 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.02 
 
 
377 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  29.84 
 
 
561 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.19 
 
 
272 aa  55.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
316 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.95 
 
 
328 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.38 
 
 
415 aa  55.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  28.46 
 
 
554 aa  55.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  31.62 
 
 
685 aa  55.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  29.2 
 
 
586 aa  55.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  30.43 
 
 
560 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  35.43 
 
 
810 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.91 
 
 
328 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1990  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.13 
 
 
470 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  30.85 
 
 
567 aa  54.7  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.99 
 
 
340 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.99 
 
 
340 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.99 
 
 
340 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.54 
 
 
354 aa  54.7  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  29.05 
 
 
523 aa  54.3  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  29.05 
 
 
538 aa  54.3  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  29.68 
 
 
819 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.55 
 
 
324 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  34.09 
 
 
369 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.07 
 
 
328 aa  53.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  32.26 
 
 
658 aa  52.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 
328 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.41 
 
 
517 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  29.2 
 
 
577 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.79 
 
 
330 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
553 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
577 aa  52  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  41.98 
 
 
387 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
553 aa  52  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.44 
 
 
406 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
553 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
553 aa  51.6  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
553 aa  51.6  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.12 
 
 
332 aa  52  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  29.2 
 
 
577 aa  52  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.04 
 
 
327 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  32.78 
 
 
487 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  23.53 
 
 
434 aa  51.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
625 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  24.47 
 
 
511 aa  50.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  30 
 
 
715 aa  50.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  27.33 
 
 
625 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.93 
 
 
329 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  27.72 
 
 
625 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>