28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0370 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0370  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  86.21 
 
 
954 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  86.21 
 
 
954 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  86.21 
 
 
954 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  43.2 
 
 
946 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  38.76 
 
 
991 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  39.13 
 
 
961 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  36.49 
 
 
945 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  36.49 
 
 
945 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  33.96 
 
 
963 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.52 
 
 
818 aa  66.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.99 
 
 
829 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  28.36 
 
 
928 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.16 
 
 
931 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  28.16 
 
 
931 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.07 
 
 
911 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  34.82 
 
 
1189 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.33 
 
 
1667 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  34.65 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  31.43 
 
 
873 aa  45.8  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.14 
 
 
1094 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.63 
 
 
457 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  38.14 
 
 
921 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.66 
 
 
689 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.87 
 
 
819 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.78 
 
 
353 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  32.99 
 
 
335 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.42 
 
 
336 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>