166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3396 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  100 
 
 		 928 aa  1914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.15 
 
 		 818 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.68 
 
 		 829 aa  247  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  28.46 
 
 		 916 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  28.37 
 
 		 873 aa  226  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.83 
 
 		 911 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 954 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  29.91 
 
 		 991 aa  207  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 954 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 		 954 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  24.48 
 
 		 921 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  28.12 
 
 		 962 aa  187  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.12 
 
 		 962 aa  187  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  26.48 
 
 		 946 aa  178  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.75 
 
 		 931 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  26.75 
 
 		 931 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  24.5 
 
 		 961 aa  174  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  26.02 
 
 		 945 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  26.02 
 
 		 945 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  24.83 
 
 		 963 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.48 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.9 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1667 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  25.54 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.98 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.51 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.46 
 
 		 348 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.03 
 
 		 689 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.69 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.98 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 		 320 aa  64.3  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.45 
 
 		 1189 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.6 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.9 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.17 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.85 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.75 
 
 		 1094 aa  61.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.62 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.4 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1170 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.05 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.2 
 
 		 328 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.59 
 
 		 556 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.25 
 
 		 384 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  27.62 
 
 		 334 aa  56.2  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 		 318 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.67 
 
 		 354 aa  55.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0370  hypothetical protein  28.36 
 
 		 284 aa  55.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 328 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.17 
 
 		 353 aa  54.7  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 		 324 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  25.63 
 
 		 325 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.68 
 
 		 327 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.16 
 
 		 810 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  24.86 
 
 		 306 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.42 
 
 		 971 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.19 
 
 		 330 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.24 
 
 		 332 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.51 
 
 		 311 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.13 
 
 		 328 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.83 
 
 		 517 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.14 
 
 		 365 aa  53.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.59 
 
 		 328 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  22.85 
 
 		 479 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.52 
 
 		 362 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 		 377 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.58 
 
 		 362 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.44 
 
 		 327 aa  52.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.12 
 
 		 370 aa  52  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.67 
 
 		 328 aa  52  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  31.48 
 
 		 329 aa  52  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.85 
 
 		 318 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.75 
 
 		 311 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.6 
 
 		 324 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3971  hypothetical protein  28.66 
 
 		 377 aa  51.6  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 		 340 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 		 340 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 		 340 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.74 
 
 		 327 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.35 
 
 		 329 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.95 
 
 		 328 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.35 
 
 		 329 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.08 
 
 		 328 aa  51.2  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.35 
 
 		 329 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.25 
 
 		 314 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.69 
 
 		 310 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.24 
 
 		 479 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.59 
 
 		 366 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  44.12 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 		 328 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.98 
 
 		 154 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 		 316 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  49.7  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>