112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3230 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  50.06 
 
 		 873 aa  876    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.11 
 
 		 962 aa  1103    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 931 aa  1925    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  57.11 
 
 		 962 aa  1103    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1925    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.79 
 
 		 818 aa  283  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.68 
 
 		 829 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  26.29 
 
 		 946 aa  178  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  24.82 
 
 		 921 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  26.75 
 
 		 928 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 954 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.45 
 
 		 911 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  26.96 
 
 		 991 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  24.13 
 
 		 945 aa  161  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  24.13 
 
 		 945 aa  161  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  23.4 
 
 		 961 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  25.87 
 
 		 916 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  24.63 
 
 		 963 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 954 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  26.03 
 
 		 954 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.08 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.89 
 
 		 1094 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.27 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1667 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.62 
 
 		 335 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.98 
 
 		 415 aa  56.2  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.06 
 
 		 353 aa  56.2  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.19 
 
 		 354 aa  55.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 		 320 aa  55.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.69 
 
 		 272 aa  55.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 328 aa  54.7  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0370  hypothetical protein  28.16 
 
 		 284 aa  54.3  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.16 
 
 		 324 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.68 
 
 		 366 aa  53.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  25.25 
 
 		 314 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.69 
 
 		 310 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 345 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  30.4 
 
 		 387 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.74 
 
 		 318 aa  52  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.7 
 
 		 580 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 354 aa  51.2  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  31.87 
 
 		 538 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28.16 
 
 		 250 aa  50.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.9 
 
 		 819 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  30.77 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  29.17 
 
 		 528 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1189 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2207  hypothetical protein  24.76 
 
 		 305 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0353672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.06 
 
 		 362 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.41 
 
 		 329 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 577 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  30.77 
 
 		 577 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  28.26 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  27.17 
 
 		 566 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.97 
 
 		 318 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.06 
 
 		 362 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  27.87 
 
 		 715 aa  48.9  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  28.42 
 
 		 479 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  27.17 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  27.17 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  30.77 
 
 		 525 aa  48.5  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  30.34 
 
 		 533 aa  48.5  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.64 
 
 		 314 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.66 
 
 		 328 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  29.67 
 
 		 567 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  29.17 
 
 		 533 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.6 
 
 		 328 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.96 
 
 		 313 aa  48.5  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.83 
 
 		 377 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.27 
 
 		 336 aa  48.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.5 
 
 		 328 aa  48.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  30.21 
 
 		 528 aa  48.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  28.12 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  28.12 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  28.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  28.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  28.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  28.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  28.12 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24 
 
 		 517 aa  47.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 335 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  31.18 
 
 		 438 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.99 
 
 		 810 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  29.35 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  23.6 
 
 		 465 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  29.17 
 
 		 560 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  26.09 
 
 		 554 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  26.09 
 
 		 554 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  26.09 
 
 		 554 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  26.09 
 
 		 588 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.43 
 
 		 317 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  29.17 
 
 		 528 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.06 
 
 		 328 aa  46.2  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  29.17 
 
 		 528 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.85 
 
 		 333 aa  45.8  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.26 
 
 		 328 aa  45.8  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>