125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0709 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2274  hypothetical protein  45.74 
 
 
962 aa  790    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  50.06 
 
 
931 aa  876    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0709  phosphoesterase  100 
 
 
873 aa  1787    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1921  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.74 
 
 
962 aa  790    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50.06 
 
 
931 aa  876    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.81 
 
 
818 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.99 
 
 
829 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3396  phosphoesterase  28.37 
 
 
928 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4335  phosphoesterase  27.03 
 
 
921 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284385  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0895  hypothetical protein  27.95 
 
 
946 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.387916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2873  putative lipoprotein  26.59 
 
 
954 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1107  putative lipoprotein  26.59 
 
 
954 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2720  beta-propeller repeat-containing protein  26.84 
 
 
954 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.501527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6216  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.58 
 
 
911 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  24.69 
 
 
945 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  24.69 
 
 
945 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1478  hypothetical protein  26.49 
 
 
991 aa  181  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  25.2 
 
 
963 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  23.83 
 
 
961 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3053  hypothetical protein  23.44 
 
 
916 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.3 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.51 
 
 
348 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.4 
 
 
348 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.89 
 
 
1094 aa  60.8  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.38 
 
 
348 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.59 
 
 
354 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
328 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  26.98 
 
 
329 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  29.1 
 
 
918 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.32 
 
 
335 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  24.87 
 
 
534 aa  55.8  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 
354 aa  55.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.32 
 
 
362 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.88 
 
 
329 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  26.91 
 
 
329 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.07 
 
 
517 aa  55.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.17 
 
 
324 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.46 
 
 
1667 aa  54.7  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  26.8 
 
 
658 aa  54.7  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.9 
 
 
362 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.77 
 
 
377 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  26.71 
 
 
329 aa  53.9  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.18 
 
 
340 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 
328 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.18 
 
 
340 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.18 
 
 
340 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  22.03 
 
 
250 aa  53.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  24.91 
 
 
329 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.04 
 
 
325 aa  53.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  26.19 
 
 
330 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.35 
 
 
313 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  25.79 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  23.43 
 
 
1189 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  24.91 
 
 
329 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.5 
 
 
329 aa  52.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.92 
 
 
324 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.78 
 
 
320 aa  52  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  25.68 
 
 
685 aa  51.6  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.37 
 
 
354 aa  51.2  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 
337 aa  51.2  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  24.6 
 
 
339 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
353 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  28.57 
 
 
566 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1257  hypothetical protein  23.03 
 
 
340 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  28.57 
 
 
554 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  26.04 
 
 
533 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  28.57 
 
 
567 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  25.47 
 
 
533 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  25 
 
 
527 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  28.57 
 
 
554 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  25 
 
 
527 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  25 
 
 
527 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  25 
 
 
527 aa  48.5  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  25 
 
 
527 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  25.7 
 
 
331 aa  48.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  22.94 
 
 
339 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  25 
 
 
557 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  25 
 
 
557 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  23.03 
 
 
339 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
577 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  28.57 
 
 
577 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  25 
 
 
528 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  26.19 
 
 
525 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
553 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
553 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
553 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
553 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  28.57 
 
 
577 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.62 
 
 
335 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  26.42 
 
 
528 aa  47.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  25.4 
 
 
538 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  26.42 
 
 
715 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>