244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4335 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  81.8 
 
 
577 aa  904    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  81.8 
 
 
577 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  76.2 
 
 
566 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  76.6 
 
 
567 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  81.8 
 
 
577 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  91.86 
 
 
588 aa  1015    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  81.19 
 
 
553 aa  908    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  88.44 
 
 
586 aa  952    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  81.01 
 
 
553 aa  905    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  76.94 
 
 
570 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  80.83 
 
 
553 aa  903    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  91.68 
 
 
554 aa  1018    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  81.01 
 
 
553 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  98.73 
 
 
554 aa  1111    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  91.86 
 
 
554 aa  1018    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  91.68 
 
 
554 aa  1018    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  100 
 
 
554 aa  1123    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  80.83 
 
 
553 aa  903    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  58.9 
 
 
561 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  57.6 
 
 
560 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  56.94 
 
 
560 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  58.38 
 
 
514 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  57.11 
 
 
528 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  57.51 
 
 
533 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  57.55 
 
 
520 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  51.34 
 
 
538 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  57.62 
 
 
533 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  52.01 
 
 
525 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  55.9 
 
 
532 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  55.25 
 
 
528 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  54.92 
 
 
527 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  54.92 
 
 
527 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  54.92 
 
 
527 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  55.25 
 
 
560 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  55.25 
 
 
528 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  54.92 
 
 
527 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  54.92 
 
 
557 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  54.92 
 
 
557 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  54.73 
 
 
527 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  54.85 
 
 
528 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  55.1 
 
 
527 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  48.86 
 
 
715 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  48.97 
 
 
720 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  48.97 
 
 
720 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  50.99 
 
 
506 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  47.38 
 
 
709 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  43.5 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  40.83 
 
 
438 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  36.82 
 
 
546 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  29 
 
 
538 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  29 
 
 
523 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  26.33 
 
 
608 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  25.49 
 
 
369 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  25.24 
 
 
545 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  24.69 
 
 
542 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  23.94 
 
 
557 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  26.1 
 
 
626 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  24.25 
 
 
557 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  24.25 
 
 
557 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  24.25 
 
 
557 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  24.21 
 
 
555 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  24.57 
 
 
647 aa  134  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  24.13 
 
 
556 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  24.21 
 
 
555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  24.21 
 
 
555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  24.21 
 
 
555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  24.21 
 
 
555 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  24.56 
 
 
555 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  23.72 
 
 
557 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  23.39 
 
 
557 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  23.44 
 
 
561 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  24.86 
 
 
564 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  24.79 
 
 
691 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  23.62 
 
 
608 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  31.84 
 
 
534 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  24.68 
 
 
658 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  21.65 
 
 
588 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  23.78 
 
 
704 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  23.78 
 
 
704 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.78 
 
 
704 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  23.78 
 
 
704 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.7 
 
 
705 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.02 
 
 
717 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  41.35 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  24.96 
 
 
685 aa  88.2  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  38.46 
 
 
511 aa  87.4  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  22.79 
 
 
717 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.1 
 
 
706 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  31.85 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  24.1 
 
 
706 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  35.29 
 
 
542 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  31.3 
 
 
495 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
711 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  36.05 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>