223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3801 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  100 
 
 
542 aa  1118    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  58.64 
 
 
555 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  58.64 
 
 
555 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  58.64 
 
 
555 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  58.64 
 
 
555 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  58.46 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  58.27 
 
 
555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  59.26 
 
 
561 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  58.73 
 
 
564 aa  571  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  59.05 
 
 
557 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  59.73 
 
 
557 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  60.54 
 
 
556 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  57.8 
 
 
557 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  57.98 
 
 
557 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  57.8 
 
 
557 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  59.16 
 
 
557 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  52.63 
 
 
608 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  51.87 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  48.99 
 
 
608 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  49.03 
 
 
545 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  29.04 
 
 
538 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  28.15 
 
 
525 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  27.16 
 
 
456 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  28.27 
 
 
528 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  27.57 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  27.57 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  27.57 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  27.03 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  27.76 
 
 
528 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  27.95 
 
 
533 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  27.33 
 
 
532 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  28.46 
 
 
533 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  27.13 
 
 
715 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  28.01 
 
 
709 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  26.2 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  27.53 
 
 
720 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  27.53 
 
 
720 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  26.98 
 
 
438 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  25.91 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  25.85 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  25.29 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  27.82 
 
 
577 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  26.19 
 
 
554 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  26.19 
 
 
554 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  24.9 
 
 
554 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  26.61 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  26.61 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  27.29 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  26.61 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  26.61 
 
 
553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  27.29 
 
 
553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  26.87 
 
 
553 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  26.25 
 
 
658 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  27.26 
 
 
523 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  27.26 
 
 
538 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  25.96 
 
 
586 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  25.96 
 
 
588 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  26.32 
 
 
566 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  26.26 
 
 
567 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  26.94 
 
 
557 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  26.94 
 
 
557 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  27.24 
 
 
514 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  26.94 
 
 
527 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  26.94 
 
 
527 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  26.94 
 
 
527 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  26.94 
 
 
527 aa  123  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  26.9 
 
 
527 aa  123  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  25.85 
 
 
685 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  26.74 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  24.66 
 
 
560 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  25.29 
 
 
560 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  26.4 
 
 
570 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  25.44 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.41 
 
 
788 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6410  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.68 
 
 
689 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  24.71 
 
 
742 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.59 
 
 
719 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  25.1 
 
 
705 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  25.1 
 
 
705 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  25.35 
 
 
709 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  24.9 
 
 
705 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.3 
 
 
771 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 
711 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.09 
 
 
768 aa  95.9  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  24.53 
 
 
717 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
777 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  26.8 
 
 
777 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.17 
 
 
702 aa  94  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.2 
 
 
719 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.6 
 
 
775 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4624  phospholipase C  24.62 
 
 
745 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  24.84 
 
 
542 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1010  phosphoesterase  23.27 
 
 
532 aa  92  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00457541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2997  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.44 
 
 
704 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  23.33 
 
 
770 aa  91.3  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.26 
 
 
771 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  24.49 
 
 
534 aa  90.1  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.63 
 
 
717 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7529  phospholipase C  24.85 
 
 
713 aa  90.1  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.05 
 
 
706 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>