254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1174 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  100 
 
 		 715 aa  1459    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  79.45 
 
 		 720 aa  1141    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  73.04 
 
 		 709 aa  1035    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  79.45 
 
 		 720 aa  1141    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  60.27 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  60.12 
 
 		 525 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  60.97 
 
 		 528 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  61.33 
 
 		 528 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  61.91 
 
 		 533 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  61.33 
 
 		 560 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  61.33 
 
 		 528 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  60.58 
 
 		 533 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  61.33 
 
 		 528 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  63.48 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  63.28 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  63.48 
 
 		 527 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  63.48 
 
 		 527 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  63.48 
 
 		 527 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  63.48 
 
 		 527 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  63.28 
 
 		 527 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  62.3 
 
 		 527 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  57.09 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  57.06 
 
 		 514 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  53.93 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  51.66 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  49.43 
 
 		 566 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  48.86 
 
 		 554 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  49.33 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  49.14 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  49.05 
 
 		 567 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  48.57 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  48.57 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  49.14 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  48.29 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  48.1 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  48.1 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  47.9 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  47.52 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  48.29 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  47.9 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  47.14 
 
 		 586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  41.9 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  38.93 
 
 		 438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  36.72 
 
 		 546 aa  264  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  28.65 
 
 		 538 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  28.47 
 
 		 523 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  26.75 
 
 		 626 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  29.19 
 
 		 557 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  27.92 
 
 		 555 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  28.27 
 
 		 555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  28.57 
 
 		 556 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  28.57 
 
 		 557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  28.52 
 
 		 555 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  28.52 
 
 		 555 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  28.52 
 
 		 555 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  27.4 
 
 		 555 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  28.39 
 
 		 561 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  28.38 
 
 		 557 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  27.8 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  27.8 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  26.99 
 
 		 608 aa  143  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  27.8 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  27.13 
 
 		 542 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  26.05 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  25.6 
 
 		 647 aa  130  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  23.55 
 
 		 691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  26.58 
 
 		 588 aa  127  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  25.92 
 
 		 608 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  32.17 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  37.97 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.46 
 
 		 775 aa  95.9  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  33.9 
 
 		 465 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  27.2 
 
 		 564 aa  94.7  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  26.32 
 
 		 534 aa  94.4  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5326  twin-arginine translocation pathway signal  23.28 
 
 		 777 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  23.28 
 
 		 777 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5405  phospholipase C, phosphocholine-specific  22.67 
 
 		 771 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0461209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.04 
 
 		 705 aa  91.3  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3104  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.43 
 
 		 768 aa  91.3  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.806748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  22.86 
 
 		 771 aa  91.3  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4858  phospholipase C  23.42 
 
 		 773 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  33.64 
 
 		 757 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  23.45 
 
 		 742 aa  87.8  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  23.81 
 
 		 709 aa  87.8  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0123  phospholipase C  22.57 
 
 		 779 aa  87.8  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 		 711 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0881  phospholipase C, phosphocholine-specific  22.22 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0219  phospholipase C  22.75 
 
 		 770 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  34.4 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  24.63 
 
 		 717 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  31.11 
 
 		 719 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.44 
 
 		 719 aa  84.3  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  30.77 
 
 		 714 aa  84  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  22.87 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.48 
 
 		 805 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>