254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4315 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  79.45 
 
 		 715 aa  1141    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  100 
 
 		 720 aa  1472    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  69.34 
 
 		 709 aa  983    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  100 
 
 		 720 aa  1472    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  60.77 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  58.77 
 
 		 538 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  58.88 
 
 		 525 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  58.88 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  59.77 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  59.77 
 
 		 560 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  59.77 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  59.77 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  59.57 
 
 		 528 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  60.04 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  59.85 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  60.04 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  60.04 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  60.04 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  60.04 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  59.85 
 
 		 527 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  59.65 
 
 		 527 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  56.36 
 
 		 520 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  56.18 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  50.26 
 
 		 532 aa  538  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  48.91 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  50.19 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  49.44 
 
 		 560 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  49.53 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  48.97 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  49.44 
 
 		 554 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  47.56 
 
 		 554 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  47.09 
 
 		 586 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  47.93 
 
 		 577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  47.84 
 
 		 588 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  47.42 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  47.93 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  47.37 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  47.93 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  47.37 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  47.74 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  47.74 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  48.31 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  47.74 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  47.74 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  49.72 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  47.75 
 
 		 570 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  42.03 
 
 		 456 aa  366  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  39.47 
 
 		 438 aa  333  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  36.33 
 
 		 546 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  28.77 
 
 		 538 aa  183  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  28.77 
 
 		 523 aa  183  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  26.7 
 
 		 626 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  27.53 
 
 		 542 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  26.69 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  26.68 
 
 		 555 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  26.63 
 
 		 557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  27.09 
 
 		 555 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  27.39 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  27.39 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  27.39 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  26.33 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  27.39 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  26.37 
 
 		 557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  26.37 
 
 		 557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  26.42 
 
 		 557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  26.37 
 
 		 557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  23.69 
 
 		 691 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  25.64 
 
 		 647 aa  125  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  25.1 
 
 		 608 aa  120  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  31.98 
 
 		 369 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  25.3 
 
 		 608 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  25.83 
 
 		 588 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  32.78 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  31.3 
 
 		 561 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  38.01 
 
 		 757 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  26.71 
 
 		 564 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  33.33 
 
 		 465 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  37.5 
 
 		 434 aa  92  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  25.83 
 
 		 534 aa  90.1  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 		 711 aa  88.2  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  33.08 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  33 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.32 
 
 		 702 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2640  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.89 
 
 		 719 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3050  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.44 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  23.09 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  29.67 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.95 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0095  non-hemolytic phospholipase C  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0079  phospholipase C  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1577  phospholipase C  27.46 
 
 		 749 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1520  phospholipase C  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0091  non-hemolytic phospholipase C  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173879  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0114  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  29.21 
 
 		 516 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1239  non-hemolytic phospholipase C precursor  27.46 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12374  membrane-associated phospholipase C 2 plcB  30.51 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3271  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.87 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0389549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4738  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.72 
 
 		 775 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.945633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5534  phospholipase C  28.72 
 
 		 777 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>