242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3875 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  81.65 
 
 		 577 aa  905    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  82.02 
 
 		 577 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  81.65 
 
 		 577 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  91.88 
 
 		 588 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  75.97 
 
 		 566 aa  794    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  80.87 
 
 		 553 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  81.05 
 
 		 553 aa  908    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  80.69 
 
 		 553 aa  905    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  98.73 
 
 		 554 aa  1111    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  77.08 
 
 		 570 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  91.7 
 
 		 554 aa  1020    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  88.65 
 
 		 586 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  100 
 
 		 554 aa  1125    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  76.74 
 
 		 567 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  80.87 
 
 		 553 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  91.7 
 
 		 554 aa  1020    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  80.69 
 
 		 553 aa  905    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  91.88 
 
 		 554 aa  1021    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  58.36 
 
 		 561 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  57.07 
 
 		 560 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  56.58 
 
 		 560 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  57.98 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  57.75 
 
 		 520 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  51.34 
 
 		 538 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  56.83 
 
 		 528 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  57.23 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  57.34 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  55.71 
 
 		 532 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  52.01 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  54.96 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  54.96 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  54.96 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  54.46 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  54.46 
 
 		 557 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  54.46 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  54.46 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  54.46 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  54.28 
 
 		 527 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  54.46 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  54.56 
 
 		 528 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  54.65 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  49.44 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  49.44 
 
 		 720 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  48.57 
 
 		 715 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  50.81 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  47.02 
 
 		 709 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  43.13 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  41.04 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  36.6 
 
 		 546 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  28.9 
 
 		 523 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  28.9 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  25.27 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  25.76 
 
 		 608 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  24.31 
 
 		 557 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  25.04 
 
 		 542 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  24.6 
 
 		 557 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  24.67 
 
 		 545 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  24.6 
 
 		 557 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  24.6 
 
 		 557 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  24.04 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  24.34 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  26.16 
 
 		 626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  24.04 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  24.04 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  24.04 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  24.04 
 
 		 555 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  24.39 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  23.67 
 
 		 647 aa  130  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  23.94 
 
 		 557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  23.76 
 
 		 557 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  23.78 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  25.23 
 
 		 564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  25 
 
 		 691 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  23 
 
 		 608 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  31.34 
 
 		 534 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  21.98 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  24.5 
 
 		 658 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  23.6 
 
 		 704 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  42.11 
 
 		 434 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  24.02 
 
 		 704 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  24.02 
 
 		 704 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.02 
 
 		 704 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.52 
 
 		 705 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  22.83 
 
 		 717 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  37.61 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  22.79 
 
 		 717 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  32.17 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  24.61 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.61 
 
 		 706 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  24.61 
 
 		 706 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  35.47 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  31.65 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 711 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08546  phosphatidylglycerol specific phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01530)  27.57 
 
 		 508 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>