239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0005 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  93.75 
 
 
560 aa  1097    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  100 
 
 
560 aa  1154    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  91.62 
 
 
561 aa  1069    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  56.15 
 
 
553 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  56.65 
 
 
577 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  56.33 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  56.51 
 
 
553 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  56.51 
 
 
553 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  56.33 
 
 
553 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  56.47 
 
 
577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  56.47 
 
 
577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  57.25 
 
 
588 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  59.09 
 
 
554 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  55.05 
 
 
567 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  58.3 
 
 
554 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  58.07 
 
 
554 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  58.7 
 
 
554 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  58.07 
 
 
554 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  58.3 
 
 
586 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  54.22 
 
 
570 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  56.91 
 
 
566 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  55.51 
 
 
520 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  52.76 
 
 
528 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  53.36 
 
 
533 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  53.36 
 
 
533 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  52.18 
 
 
532 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  55.38 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  55.58 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  55.38 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  55.38 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  55.38 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  55.38 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  51.76 
 
 
528 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  50.5 
 
 
538 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  51.57 
 
 
560 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  55.18 
 
 
527 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  51.57 
 
 
528 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  51.57 
 
 
528 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  54.98 
 
 
527 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  50.5 
 
 
525 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  48.53 
 
 
514 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  49.53 
 
 
720 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  49.53 
 
 
720 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  49.14 
 
 
715 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  48.78 
 
 
709 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  46.95 
 
 
506 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  42.77 
 
 
456 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  38 
 
 
438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  33.47 
 
 
546 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  28.77 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  28.77 
 
 
538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  25.4 
 
 
608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  25.39 
 
 
626 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  24.05 
 
 
556 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  25.29 
 
 
542 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  23.38 
 
 
557 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  23.59 
 
 
555 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  23.13 
 
 
555 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  23.13 
 
 
555 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  23.13 
 
 
555 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  23.13 
 
 
555 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  22.95 
 
 
555 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  22.81 
 
 
557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  23.06 
 
 
557 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  23.06 
 
 
557 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  22.62 
 
 
557 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  23.06 
 
 
557 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  28.65 
 
 
369 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  22.9 
 
 
545 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  25.73 
 
 
647 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  35.9 
 
 
534 aa  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  23.36 
 
 
561 aa  100  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  24.34 
 
 
564 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  40.91 
 
 
434 aa  90.5  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  23.81 
 
 
685 aa  87.4  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  22.48 
 
 
608 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  27 
 
 
691 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  32.45 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  22.15 
 
 
705 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  33.52 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  33.52 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  33.52 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.32 
 
 
805 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
506 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
506 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  20.58 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  36.91 
 
 
495 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2739  hypothetical protein  30.56 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0522318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  31.62 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  31.18 
 
 
711 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.36 
 
 
700 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  27.85 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.36 
 
 
700 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  30.41 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  21.47 
 
 
706 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5529  phosphoesterase  33.1 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0242693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>