246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3648 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  100 
 
 		 560 aa  1151    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  93.75 
 
 		 560 aa  1097    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  92.51 
 
 		 561 aa  1079    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  56.68 
 
 		 553 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0105  acid phosphatase  56.51 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3884  acid phosphatase AcpA  56.68 
 
 		 553 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1655  acid phosphatase AcpA  56.51 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3966  acid phosphatase AcpA  56.68 
 
 		 553 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3463  acid phosphatase AcpA  56.51 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.853995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2888  acid phosphatase AcpA  56.33 
 
 		 577 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3086  acid phosphatase AcpA  56.33 
 
 		 577 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  55.42 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  59.49 
 
 		 554 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  54.64 
 
 		 570 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  56.71 
 
 		 588 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  58.89 
 
 		 554 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  57.71 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  58.1 
 
 		 586 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  57.48 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  57.48 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  57.72 
 
 		 566 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1697  acid phosphatase  56.51 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4545  phosphoesterase  53.75 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1914  acid phosphatase  54.56 
 
 		 533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  54.37 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1612  acid phosphatase  52.78 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  52.08 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  55.98 
 
 		 557 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  56.18 
 
 		 557 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  55.98 
 
 		 527 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  55.98 
 
 		 527 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  56.18 
 
 		 527 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1312  acid phosphatase  52.55 
 
 		 528 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0809343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  52.09 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  55.98 
 
 		 527 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  55.98 
 
 		 527 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1379  acid phosphatase  51.96 
 
 		 528 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.589367  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0919  phosphoesterase  51.96 
 
 		 560 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1401  phosphoesterase  51.96 
 
 		 528 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2671  acid phosphatase AcpA  55.38 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5887  acid phosphatase  49.82 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  49.44 
 
 		 720 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  49.44 
 
 		 720 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  49.14 
 
 		 715 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  48.41 
 
 		 709 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  46.95 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  42.57 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  38.94 
 
 		 438 aa  286  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1749  phosphoesterase  34.26 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0429727  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  30.35 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  30.35 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  24.95 
 
 		 608 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  25.09 
 
 		 626 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4272  phospholipase C  24.43 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  23.93 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3801  Phospholipase C protein  24.66 
 
 		 542 aa  118  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1674  phospholipase C  23.86 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0611  phosphoesterase family protein  23.61 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.910301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1822  phosphoesterase family protein  23.61 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670556  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0856  phosphoesterase family protein  23.61 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2344  phosphoesterase family protein  23.61 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4229  phospholipase C  23.48 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1043  phosphoesterase family protein  23.42 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4021  phospholipase C  23.73 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.614741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6008  phospholipase C  23.54 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.592635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4345  phospholipase C  23.73 
 
 		 557 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3755  phospholipase C  23.3 
 
 		 557 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206328  normal  0.260447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  26.13 
 
 		 647 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3848  phosphoesterase  29.17 
 
 		 369 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.352013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7483  phosphoesterase  23.58 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  23.97 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  35.5 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0722  phosphoesterase  24.25 
 
 		 564 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300017  normal  0.349987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  40.91 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3755  phosphoesterase  21.67 
 
 		 608 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000407055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  28 
 
 		 691 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0881  phosphoesterase  24.74 
 
 		 685 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3054  phosphoesterase  23.35 
 
 		 658 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  34.59 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  29.84 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  33.94 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  33.94 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5018  phosphoesterase  21.35 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.486141  normal  0.0744448 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  29.1 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0606  phosphoesterase  33.62 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  34.81 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  21.11 
 
 		 705 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1010  phosphoesterase  22.83 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00457541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  31.18 
 
 		 711 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0182  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.36 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  30.51 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2739  hypothetical protein  30 
 
 		 651 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0522318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0175  phospholipase C, phosphocholine-specific  26.78 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  21.6 
 
 		 717 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>