33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3581 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1543    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  52.51 
 
 		 724 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1165  phosphoesterase  26.56 
 
 		 368 aa  141  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  37.96 
 
 		 720 aa  94.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  37.96 
 
 		 720 aa  94.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  37.95 
 
 		 709 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  33.49 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1521  phosphoesterase  23.85 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2001  phosphoesterase  21.69 
 
 		 626 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3589  phosphoesterase  22.48 
 
 		 337 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  33.91 
 
 		 601 aa  55.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  40 
 
 		 787 aa  55.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0232  phosphoesterase  22.56 
 
 		 260 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.583937 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2847  phosphoesterase  21.13 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0330069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3658  phosphoesterase  22.09 
 
 		 335 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3501  phosphoesterase  22.87 
 
 		 335 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0739  phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase  36.9 
 
 		 321 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4614  phosphoesterase  22.14 
 
 		 404 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  44.29 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3538  phosphoesterase  22.14 
 
 		 404 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  31.3 
 
 		 956 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4378  phosphoesterase  24.05 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.614258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6259  phosphoesterase  36.76 
 
 		 292 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.651293  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  54.76 
 
 		 783 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  33.65 
 
 		 282 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13339  acid phosphatase  29.76 
 
 		 299 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4401  phosphoesterase  26.47 
 
 		 310 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  52.5 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4632  phosphoesterase  22.07 
 
 		 427 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  29.71 
 
 		 604 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1538 aa  45.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  55.26 
 
 		 589 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  43.1 
 
 		 588 aa  44.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>