59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4614 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3538  phosphoesterase  100 
 
 
404 aa  827    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4614  phosphoesterase  100 
 
 
404 aa  827    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3200  phosphoesterase  53.2 
 
 
380 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.671859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4632  phosphoesterase  52 
 
 
427 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4378  phosphoesterase  51.33 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.614258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5027  phosphoesterase  41.23 
 
 
449 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3922  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5153  phosphoesterase  29.36 
 
 
437 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1165  phosphoesterase  31.9 
 
 
368 aa  136  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4773  phosphoesterase  35.03 
 
 
546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749581  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0739  phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase  30.88 
 
 
321 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3589  phosphoesterase  28.61 
 
 
337 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3658  phosphoesterase  28.88 
 
 
335 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  29.87 
 
 
396 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2847  phosphoesterase  27.94 
 
 
396 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0330069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3501  phosphoesterase  28.32 
 
 
335 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1617  phosphoesterase  30.1 
 
 
281 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594296  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0232  phosphoesterase  30.03 
 
 
260 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.583937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2001  phosphoesterase  28.4 
 
 
626 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322821  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04055  acid phosphatase PHOa (AFU_orthologue; AFUA_1G03570)  23.51 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00237417  hitchhiker  0.00452392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4401  phosphoesterase  26.75 
 
 
310 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07142  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03660)  26.8 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.851624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1521  phosphoesterase  27.85 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1816  phosphoesterase  25.44 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.454505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13339  acid phosphatase  26.01 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1007  phosphoesterase  25 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6259  phosphoesterase  26.33 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.651293  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1603  phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase  25.99 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.659392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  23.11 
 
 
724 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  26.64 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1275  putative phosphoesterase familiy protein  24.66 
 
 
626 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0014  phosphoesterase  24.77 
 
 
647 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  22.14 
 
 
757 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  24.82 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  23.85 
 
 
691 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  26.52 
 
 
506 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4613  Phospholipase C  23.88 
 
 
474 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3537  Phospholipase C  23.88 
 
 
474 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  36.17 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  36.17 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  24.67 
 
 
709 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1827  phosphoesterase  26.54 
 
 
608 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  36.17 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  32.98 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1863  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0968  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0331  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0411  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0230  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1778  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1368  phosphoesterase family protein  26.24 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.468542  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6095  phosphoesterase  27.38 
 
 
503 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4267  phosphoesterase  26.1 
 
 
561 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5185  Phospholipase C  25.17 
 
 
457 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3323  phosphoesterase  28.93 
 
 
1019 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1106  phosphoesterase family protein  25.75 
 
 
463 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.568201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  26.74 
 
 
522 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1636  phosphoesterase family protein  26.36 
 
 
555 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  23.91 
 
 
523 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  23.91 
 
 
538 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>