14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3624 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1244    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0737  hypothetical protein  46.21 
 
 		 625 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  35.11 
 
 		 579 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  35 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0144  hypothetical protein  34.67 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  32.19 
 
 		 605 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  32.01 
 
 		 588 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  30.43 
 
 		 956 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  33.91 
 
 		 757 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  41.67 
 
 		 380 aa  53.9  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  27.32 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  39 
 
 		 783 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  39.19 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  34.88 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>