42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0272 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  51.32 
 
 		 956 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1596    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  42.23 
 
 		 1426 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  28.88 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  28.16 
 
 		 604 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  36.56 
 
 		 296 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  37.58 
 
 		 282 aa  95.1  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  34.43 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  35.63 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  40.46 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  43.07 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.72 
 
 		 1107 aa  73.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  41.56 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  28.16 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  37.84 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  35.43 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  42 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.75 
 
 		 772 aa  63.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  33.56 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  36.17 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  29.82 
 
 		 272 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  27.39 
 
 		 491 aa  57.4  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  32.7 
 
 		 5899 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.1 
 
 		 325 aa  56.6  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  31.06 
 
 		 380 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 508 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  39.33 
 
 		 757 aa  55.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  28.27 
 
 		 724 aa  54.7  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  32.48 
 
 		 477 aa  54.3  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  31.64 
 
 		 703 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  30.46 
 
 		 475 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  29.45 
 
 		 720 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  29.45 
 
 		 720 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  32.65 
 
 		 588 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1538 aa  47.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  34.48 
 
 		 7919 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  34.48 
 
 		 7679 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0149  hypothetical protein  40.4 
 
 		 579 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0144  hypothetical protein  40.4 
 
 		 577 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  28.79 
 
 		 3834 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>