16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2957 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  100 
 
 		 703 aa  1415    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  26.1 
 
 		 773 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  25.77 
 
 		 773 aa  92.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  35.04 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  40.34 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  38.14 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.99 
 
 		 2820 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  32.62 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.15 
 
 		 2853 aa  57.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 		 11716 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  30.13 
 
 		 296 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  31.64 
 
 		 783 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  31.11 
 
 		 1672 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  30.93 
 
 		 2001 aa  47.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3664  hypothetical protein  30.56 
 
 		 855 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.57 
 
 		 1673 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>