148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0115 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 1672 aa  3159    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  42.13 
 
 		 1222 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  72.01 
 
 		 1673 aa  2237    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  42.53 
 
 		 1879 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  42.38 
 
 		 1232 aa  262  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.82 
 
 		 3544 aa  214  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 		 3699 aa  194  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.66 
 
 		 3699 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  38.38 
 
 		 3542 aa  172  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.48 
 
 		 2402 aa  171  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  39.15 
 
 		 3911 aa  160  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.15 
 
 		 3563 aa  155  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  37.38 
 
 		 683 aa  154  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  45 
 
 		 1394 aa  154  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  33.04 
 
 		 1544 aa  152  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.41 
 
 		 692 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.49 
 
 		 4465 aa  136  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 4231 aa  132  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.48 
 
 		 2042 aa  125  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  27.55 
 
 		 2522 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  58.87 
 
 		 757 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.81 
 
 		 1779 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.9 
 
 		 11716 aa  106  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  72.62 
 
 		 1310 aa  105  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  35.27 
 
 		 1626 aa  104  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  32.82 
 
 		 3244 aa  101  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.72 
 
 		 887 aa  100  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.95 
 
 		 1272 aa  98.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.68 
 
 		 2079 aa  97.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1214 aa  97.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.43 
 
 		 859 aa  96.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  32.78 
 
 		 813 aa  93.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  29.53 
 
 		 2636 aa  92.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  67.03 
 
 		 1848 aa  88.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  66.67 
 
 		 1035 aa  86.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.49 
 
 		 2402 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  40.16 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  51.35 
 
 		 891 aa  75.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  40.7 
 
 		 1148 aa  72.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  46.67 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  33.33 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  31.35 
 
 		 968 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.92 
 
 		 2839 aa  71.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.73 
 
 		 2853 aa  71.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  51.02 
 
 		 556 aa  68.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.09 
 
 		 2074 aa  67.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  27.41 
 
 		 664 aa  67  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  61.84 
 
 		 1695 aa  66.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.88 
 
 		 641 aa  67  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  44.55 
 
 		 1129 aa  65.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  28.92 
 
 		 2820 aa  65.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.19 
 
 		 3474 aa  64.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.02 
 
 		 3598 aa  63.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.28 
 
 		 1025 aa  63.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.03 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.3 
 
 		 1012 aa  62.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  51.56 
 
 		 471 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.95 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  37.82 
 
 		 2375 aa  60.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  30.6 
 
 		 658 aa  61.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  37.5 
 
 		 672 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  43.59 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.75 
 
 		 1269 aa  59.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.93 
 
 		 1123 aa  59.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  32.11 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.16 
 
 		 1597 aa  58.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  26.03 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40.38 
 
 		 247 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.23 
 
 		 1369 aa  58.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0654  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.09 
 
 		 311 aa  57.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  35.96 
 
 		 646 aa  57.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 		 1292 aa  57.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.3 
 
 		 3015 aa  57.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.58 
 
 		 311 aa  57  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  26.38 
 
 		 1066 aa  57  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.21 
 
 		 2713 aa  57  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  27.98 
 
 		 939 aa  57  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  27.03 
 
 		 2476 aa  57  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.3 
 
 		 1953 aa  56.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  41.57 
 
 		 300 aa  56.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.19 
 
 		 2503 aa  55.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.2 
 
 		 1884 aa  55.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 		 1865 aa  55.5  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 		 684 aa  55.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  36.18 
 
 		 926 aa  55.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 		 2302 aa  55.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  23.63 
 
 		 684 aa  54.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 		 1842 aa  53.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1064 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.97 
 
 		 2507 aa  53.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  36.27 
 
 		 2802 aa  53.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  26.21 
 
 		 952 aa  52.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1030 aa  52.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  54.24 
 
 		 1095 aa  52.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 1769 aa  52.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.58 
 
 		 815 aa  52  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.31 
 
 		 763 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>