67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1266 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  61.11 
 
 		 641 aa  773    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  85.82 
 
 		 684 aa  1143    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  59.22 
 
 		 664 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  100 
 
 		 684 aa  1366    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  42.79 
 
 		 723 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  33.54 
 
 		 607 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.37 
 
 		 629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 658 aa  140  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2586  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.37 
 
 		 610 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3166  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2148  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.19 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1422  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.19 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1647  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2673  outer membrane autotransporter  27.37 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2533  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain/outer membrane autotransporter barrel domain-containing protein  27.19 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1948  outer membrane autotransporter  25.21 
 
 		 627 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  24.6 
 
 		 630 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  23.78 
 
 		 646 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  23.56 
 
 		 646 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  24.23 
 
 		 594 aa  84  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  22.05 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  23.31 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  21.6 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  21.85 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  22.54 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  21.09 
 
 		 629 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  27.31 
 
 		 1369 aa  72  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  21.67 
 
 		 597 aa  67.8  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  32 
 
 		 1886 aa  64.7  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  23.72 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.3 
 
 		 617 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 		 1673 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  23.3 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24 
 
 		 1222 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.98 
 
 		 774 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.44 
 
 		 985 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.86 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.01 
 
 		 1012 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 		 972 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.5 
 
 		 1489 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  27.86 
 
 		 1068 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  23.94 
 
 		 939 aa  55.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  23.96 
 
 		 763 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  23.63 
 
 		 1672 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  25.21 
 
 		 329 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  25.21 
 
 		 329 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  22.62 
 
 		 759 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  26.29 
 
 		 1025 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.56 
 
 		 1134 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 994 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  21.84 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  25 
 
 		 647 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  21.84 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  21.84 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.37 
 
 		 1769 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  25.39 
 
 		 1782 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  25.06 
 
 		 319 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  27.1 
 
 		 647 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  27.43 
 
 		 814 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.61 
 
 		 1242 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  25.13 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  22.83 
 
 		 349 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.96 
 
 		 1179 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  28.49 
 
 		 2407 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  24.61 
 
 		 288 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.78 
 
 		 2848 aa  43.9  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>