35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 336 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  46.33 
 
 		 859 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50.46 
 
 		 1394 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  42.51 
 
 		 1695 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  43.48 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  54.93 
 
 		 2042 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.96 
 
 		 726 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  65.48 
 
 		 757 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.25 
 
 		 740 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  42.14 
 
 		 14944 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  55 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14944  predicted protein  27.25 
 
 		 4372 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  37.41 
 
 		 1310 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.93 
 
 		 12684 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92778  predicted protein  27.51 
 
 		 1716 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  57.38 
 
 		 1848 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  50 
 
 		 1672 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  37.24 
 
 		 1527 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  38.75 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.18 
 
 		 1673 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  53.41 
 
 		 556 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  26.32 
 
 		 597 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  33.75 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.64 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  26.09 
 
 		 604 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31813  predicted protein  28.41 
 
 		 1581 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.209863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1876 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  37.93 
 
 		 14609 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_93102  predicted protein  31.25 
 
 		 1360 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1459  IPT/TIG domain protein  30 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  31.36 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  52.5 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.25 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  43.48 
 
 		 1081 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  51.72 
 
 		 1095 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>