26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5752 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  100 
 
 		 512 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6262  lipase, class 3  30.88 
 
 		 346 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5957  lipase class 3  28.95 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2014  putative lipase  27.24 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2073  putative lipase  26.85 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5954  lipase class 3  28.11 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489511  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  28.1 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2321  lipase class 3  32.39 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.57 
 
 		 859 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.77 
 
 		 1394 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.75 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.85 
 
 		 2042 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  35.42 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.76 
 
 		 757 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  31.25 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.22 
 
 		 1527 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  23.47 
 
 		 383 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  27.15 
 
 		 240 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  27.15 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  27.15 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  26.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  26.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  35.21 
 
 		 1310 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  26.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  26.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  26.06 
 
 		 240 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>