32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5889 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 859 aa  1680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.92 
 
 		 1394 aa  361  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  39.07 
 
 		 1695 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  44.63 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  58.28 
 
 		 2042 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.92 
 
 		 247 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  59.77 
 
 		 757 aa  90.9  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  45.64 
 
 		 1672 aa  80.9  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92778  predicted protein  27.87 
 
 		 1716 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14944  predicted protein  23.96 
 
 		 4372 aa  78.2  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.05 
 
 		 1673 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.69 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  36.9 
 
 		 14944 aa  75.1  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  48.57 
 
 		 1310 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34 
 
 		 1848 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 		 1284 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.48 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.96 
 
 		 12684 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.32 
 
 		 1876 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.07 
 
 		 1035 aa  57.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  35.33 
 
 		 1527 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  38 
 
 		 287 aa  55.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  34.44 
 
 		 512 aa  54.3  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30 
 
 		 597 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31813  predicted protein  25.18 
 
 		 1581 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.209863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  34.75 
 
 		 300 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0844  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  42.31 
 
 		 311 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  27.35 
 
 		 14609 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0654  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.12 
 
 		 311 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.46 
 
 		 556 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15263  predicted protein  30.22 
 
 		 357 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.510611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  26.6 
 
 		 1081 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>