17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3471 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  92.59 
 
 		 297 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3736  hypothetical protein  57.86 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1640  IPT/TIG domain-containing protein  47.92 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  48.53 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1924  IPT/TIG domain-containing protein  48.18 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1459  IPT/TIG domain protein  42.29 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2172  hypothetical protein  34.01 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.63 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.57 
 
 		 726 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.18 
 
 		 12684 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.92 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  27.38 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2592  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1743 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1357  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1743 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0819282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.22 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1256  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1742 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.706076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>