12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1924 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1924  IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  62.89 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3736  hypothetical protein  48.48 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1640  IPT/TIG domain-containing protein  46.92 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000419405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.08 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.08 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1459  IPT/TIG domain protein  40.45 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2172  hypothetical protein  31.34 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.14 
 
 		 726 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.08 
 
 		 363 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  26.62 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.99 
 
 		 740 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>