13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3409 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  92.59 
 
 		 297 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3736  hypothetical protein  56.54 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1640  IPT/TIG domain-containing protein  48.67 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  48.16 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1924  IPT/TIG domain-containing protein  47.79 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1459  IPT/TIG domain protein  44.32 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2172  hypothetical protein  33.67 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.68 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.86 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.81 
 
 		 12684 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  26.54 
 
 		 414 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>