14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1684 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 363 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  25.38 
 
 		 1695 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.02 
 
 		 1394 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.45 
 
 		 1527 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  30.43 
 
 		 1245 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.52 
 
 		 726 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.86 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.88 
 
 		 740 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  23.53 
 
 		 597 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.88 
 
 		 2042 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  38.27 
 
 		 1081 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1924  IPT/TIG domain-containing protein  30.08 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1459  IPT/TIG domain protein  28.86 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.447076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  39.22 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>